Gernika a été durant des siècles le lieu de réunion des habitants de Bizkaia. Chaque commune envoyait jadis ses représentants débattre des problèmes communs de la Seigneurie. Ces assemblées étaient tenues à côté de l'Arbre de Gernika et s'appelaient Juntas Generales de Bizkaia. Elles ont subsisté jusqu'en 1876, date à laquelle ont été abolies les lois qui régissaient la vie de la Bizkaia, c'est à dire les Fueros (Droit territorial).

Après 102 ans de suspension, les Juntas reviennent en 1979. C'est alors le départ de la deuxième étape de la vie de cette institution forale.

La maison des Assemblées et l'Arbre de Gernika sont les symboles vivants de l'histoire du Peuple Basque. Siège de l'organe institutionnel de Bizkaia, l'ensemble architectural se dresse à côté du chêne foral, point de rencontre de tous les territoires de Euskal Herria réunis dans une même tradition culturelle et ethnographique, tradition qui va au-delà de toutes les frontières politiques.